获得神秘船票最常规的途径是推进游戏的特定剧情。完成正辉博士的支线任务是其标准获取方式，具体触发条件位于华蓝市北部。玩家需要先击败华蓝市的水系道馆馆主，之后从城市右上角的出口前往25号路。在这条道路上，玩家需依次击败数名训练家并解决一名火箭队成员的拦截，最终抵达道路尽头的小屋。与屋内变身为皮皮的正辉对话后，操作电脑即可帮助其恢复人类形态，作为回报，正辉会将神秘船票赠送给玩家。需前往正辉小屋的路径上存在小树障碍，因此队伍中必须有一只能够使用居合斩技能的宝可梦才能顺利通过。成功获得船票后，建议返回精灵中心恢复状态，为后续行程做好准备。
除了常规的剧情获取，神秘船票在游戏的不同版本中还存在其他获取方式。对于英文版本的游戏，存在一个隐藏的彩蛋方法。玩家可以进入任意一家商店，找到柜台上的调查表或留言簿，按顺序填写LINK、TOGETHER、WITH、ALL这四个特定单词。完成操作后店员会给予提示，保存游戏并重新读取，在游戏开始菜单中便有可能出现神秘礼物的选项，其中包含的礼物之一就是神秘船票。神秘船票最初是作为官方限定活动的赠品而设计的，玩家通过参与当时的官方活动并连接网络，在游戏的礼物系统中直接领取。对于非英文版本且无法触发上述彩蛋的玩家，在常规途径之外，有时会借助特殊指令来获取，但这种方式可能影响游戏体验，尝试前务必妥善保存原有存档。
神秘船票的核心价值在于它能够解锁游戏中的圣安奴号游轮剧情以及通关后的岛屿扩展内容。获得船票后，玩家需要前往枯叶市的码头，将船票出示给检票员即可登上圣安奴号游轮。船上布满训练家，是获取经验值的好机会，最终需要在船长室帮助船长并获得秘传技能一字斩，此后游轮才会启航，这个技能是清除道路障碍、推进主线进程的关键道具。更为重要的是，在完成游戏的主线剧情后，这张船票将发挥其神秘的效用，玩家可以再次回到枯叶市码头，乘船前往一系列外围岛屿。这些岛屿上不仅有全新的地形机制等待探索，还栖息着火焰鸟等传说中的宝可梦，并设有提供高强度对战挑战的训练设施，从而极大地丰富了游戏的可玩内容与探索深度。
